Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2021
Структуры и последовательности нуклеиновых кислот
Результаты Только для студентов и преподавателей
Записаться в очередь на проверку
Блок 1: Пространственные структуры нуклеиновых кислот
1. Нуклеиновые кислоты, строение и структура (лекция)
6 сентября 2022, А.В. Головин
[ презентация ]
2. Мини-контрольная. Химическое строение нуклеиновых кислот
13 сентября 2022, А.В. Головин
3. A- и В- формы ДНК. Структура РНК
20 сентября 2022, А.В. Головин.
[ задания ] [ подсказки ] [ ipynb ]
4. Комплексы ДНК-белок
27 сентября 2022, А.В. Головин
[ задания ] [ подсказки ] [ задания-jupyter ]
5. Итоговая контрольная
4 октября 2022, А.В. Головин
Блок 2: Последовательности нуклеиновых кислот
6. Секвенирование по Сэнгеру
11 октября 2022, А.А. Жарикова
[ презентация ] [ задание ]
7. Нуклеотидные банки данных
18 октября 2022, Д. Диброва
[ презентация ] [ задания ]
8. Нуклеотидный BLAST
25 октября 2022, Д. Диброва
[ презентация ] [ задания ]
9. Entrez Direct, BLAST+, EMBOSS
1 ноября 2022, И. Русинов, Д. Диброва
[ презентация ] [ задания ] [ видеозапись с прошлого года ]
10. Выравнивание геномов
8 ноября 2022, С.А. Спирин
[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ]
Блок 3. Сборка и анализ геномов
11. Введение в анализ NGS
15 ноября 2022, Анастасия Жарикова
[ презентация ]
[ задания ]
12. NGS. Анализ экзомов
22 ноября 2022, Анастасия Жарикова
[ презентация ]
[ задания ]
13. NGS. Анализ транскриптомов
29 ноября 2022, Анастасия Жарикова
[ презентация ]
[ задания ]
14. Работа с геномными интервалами. Bedtools, gnomAD
6 декабря 2022, Анастасия Жарикова
15. Сборка de novo
13 декабря 2022, С.А.Спирин
[ презентация ] [ задания ]
16. Коллоквиум
22 декабря 2022
[ программа ]
[ задание для выполнения в день лекции ] [ Программа NPG-explorer: инструкция и сайт для скачивания ]