Страница 4 семестра

Блок 1: Молекулярная филогения

1. Что такое филогенетическое дерево
• Филогенетическое дерево
2. Реконструкция филогении
• Реконструкция филогении
3. Укоренение и будстрэп
• Поиск паралогов и ортологов

Блок 2: Профили, сигналы и эволюционные домены

1. Сигналы, мотивы, PWM
• Сигналы, мотивы, PWM
2. Мотивы в белках. PSSM и паттерны. PSI-BLAST. Банк Prosite
• PSI-BLAST и Prosite
3. Домены. Pfam. HMM профиль.
• Домены. Pfam. HMM профиль.
4. ROC-кривая
• HMM-profile

Блок 3: Функциональные классы белков

1. Ферменты и метаболические пути. База данных KEGG.
• KEGG
2. Геномное окружение. База данных GO
• GO
3. Трансмембранные белки
• Трансмембранные белки