Шестой семестр

Мои контакты:

kodomo.fbb.msu.ru
olya_zol@inbox.ru
я вконтакте




Мои результаты:

Первый Семестр
Второй Семестр
Третий Семестр
Четвертый Семестр

Шестой Семестр


Молекулярное моделирование биополимеров

  1. Работа в Pymol
    1. Знакомство с Pymol
    2. Работа в Pymol

  2. Cеми-эмпирические вычисления
    3. MOPAC

  3. Вычисления ab inito
    4. Ab initio вычисления для нафталина и азулена

  4. Вычисление параметров для молекулярной механики
    5. Вычисление параметров для валентных углов
    6. Вычисление точных зарядов и VdW параметров
    7. Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS


  5. 8-9. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS GROMACS
    10. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
    11. Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка
    12. Пример использования трехмерного QSAR анализа для предсказания активности низкомолекулярных соединений в отношении данного белка.
    13. Рассчёт энергии сольватаци димера этилен-гликоля методом FEP.

©Золотарева Ольга, 2012