Характеристика вируса Rabbit hemorrhagic disease virus

Rabbit hemorrhagic disease virus - вирус геморрагической болезни кролика. Это РНК-вирус, без стадии ДНК. Геном состоит из одноцепочечной РНК позитивной полярности, то есть транслируется исходная РНК (single-strand RNA positive-strand viruse). Несмотря на то что стадии ДНК нет, в базах данных хранится последовательность в нуклеотидах именно этого типа.

Идентификатор записи, содержащий полный геном этого вируса - DQ280493. В аннотации указано, что длина генома составляет 7437 нуклеотидов. Сведения о генах этого вируса указаны в таблице 1. Первый ген отвечает за синтез пролипротеина (polyprotein), а второй – минорный капсидный белок (minor capsid protein).

Таблица 1. Гены вируса Rabbit hemorrhagic desease (идентификатор записи EMBL - DQ280493, идентификатор базы NCBI - NC_001543.1)

Расположение генов этого вируса представлено на рисунке 1. Эти гены пересекаются, общий участок содержит 20 нуклеотидов (с 7025 по 7044). Подробнее этот участок изображен на рисунке 2.

Рисунок 1. Расположение генов Rabbit hemorrhagic disease virus по данным NCBI. Рисунок получен с помощью геномного браузера сайта NCBI

Рисунок 2. Участок генома Rabbit hemorrhagic disease virus с 2 перекрещенными генами. Рисунок получен с помощью геномного браузера сайта NCBI