| Учебный сайт Саши Погорельской |
|
|
||||||
| Главная | Семестры | Скрипты | Обо мне | Ссылки | ||
|
|
Анализ одного из белков Syntrophus aciditrophicus SB Рассмотрим один из других генов Syntrophus aciditrophicus SB. Продуктом трансляции гена является белок-регулятор транскрипции, он относится к семейству репрессоров (TetR (Tet Repressor Protein) family transcriptional regulator). Его идентификатор YP_461098.1. Белки этого семейства вовлечены в контроль транскрипции генов, отвечающих за проведение биосинтеза антибиотиков, участвуют в реакции на изменение осмотического давления [2]. Краткая информация об этом белке представлена в таблице 1. На рисунке 1 показано графическое представление участка ДНК, кодирующего этот белок. Маловероятно, что он входит в оперон, так как соседние гены кодируют белки, выполняющие совсем другие функции, также левее располагаются гены на комплементарной цепи (значит, они не могут образовать оперон), а правее расстояния между генами довольно большое для оперона. Между изображенными генами расстояние 113, 822, 181, 851 и 72 пары нуклеотидов соответственно. Их рамки считывания относительно гена, кодирующего белок TetR family transcriptional regulator соответственно: -1, -3, +3, +1 (исходный ген), +2, +2. Таблица 1. Основные свойства белка-регулятора транскрипции из организма Syntrophus aciditrophicus SB (индентификатор YP_461098.1)
Рисунок 1. Ген, кодирующий белок-регулятор транскрипции (выделен рамкой) и ближайшие к нему. Рисунок получен с помощью геномного браузера сайта NCBI. Дальнейее исследование этого белка представлено в разделе "Белок" второго семестра. |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| © Pogorelskaya Sasha | Last modification date: 19.02.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||