В этом семестре выполнено несколько практикумов. Заданием было изучить базу данных Protein Data Base и продолжить исследование белка-регулятора транскрипции (TetR (Tet Repressor Protein) family transcriptional regulator), выданного мне в первом семестре. Результаты первого задания по определению общей структуры белка представлены на странице "Белок, общая информация".

Более детальная информаия о построении молекулы и видах связи в ней находтся на страницах "Белок, вторичные структуры", "Белок, внутримолекулярные взаимодействия" и "Белок, гидрофобные взаимодействия".

Об одном из лигандов белка-регулятора транскрипции можно прочитать на странице "Лиганды".

На странице скоро будет представлено совмещение белковых структур триптофан-синтаз (идентификатор PDB 1wdw).

На одном из практикумов мы разбирали использование базы данных PubMed. Эта база данных со статьями имеет удобный поиск по множетсву полей. В ней можно найти большое количество статей по естественно-научной тематике. Результаты использования этой базы для поиска информации о нобелевской премии по физиологии и медицине 1997 года предствлены здесь.

Также мы рассмотрели базу данных с записями о белках, включающими большой набор характеристик. Изучение этих записей проводилось на примере белка-регулятора транскрипции, результаты здесь. Использование расширенного поиска показано на примере оперона АТФ-синтазы Syntrophus aciditrophicus SB.