Данная страница посвящена учебному блоку по трёхмерным структурам белков и исследованию с помощью них различных взаимодействий, как в самом белке, так и с его окружением (молекулами воды, лигандами).
Все основные картинки с изображением структуры белков получены с помощью программы Jmol, которая написана на языке Java и поддерживает такой формат, как PDB (Protein Data Bank). В этом формате хранится большинство 3-D структур белков.
Пространственные структуры белков. Визуализатор Jmol
Jmol - программа для просмотра трехмерных структур:
Внутримолекулярные взаимодействия в белке дегидратаза (dehydratase):
- Остовные водородные связи в α-спиралях и β-листах
- Внутримолекулярные взаимодействия боковых цепей
- Гидрофобные взаимодействия
Белок и «лиганд»:
Совмещение структур белков:
Решение создать отдельную страницу с данным блоком возникло из-за довольно большого количества изображений белка и файлов, связанных с ним. Всё это связано с удобством хранения информации в более структурированной форме, но, боюсь, из-за лишних страниц навигация по сайту может стать менее удобной. Поэтому на каждой странице, посвящённой структуре этого белка, будет размещена ссылка на данную страницу.