Второй семестр

• Блок 1
  • Белок GLK в банках Swiss-Prot и TrEMBL
  • Работа с системой SRS
  • Выравнивание вручную
  • Матрицы замен
  
  
• Блок 2
  • Матрицы переходов глобального и локального выравниваний
  • Программы выравнивания
  • Работа с программой BLAST
  
  
• Блок 3
  • Сравнение фрагмента полного множественного выравнивания, полученного с помощью программы ClustalW, с соответствующим фрагментом "эталонного" выравнивания из Pfam
  • Создание паттернов для поиска и распознавания аминокислотных последовательностей
  • Мотивы в белке GLK_ECOLI, описанные в БД Prosite
  • Доменная структура белка GLK_ECOLI
  • Мотивы в белке GLK_ECOLI, описанные в БД Prosite
  • PSI-BLAST
  • Филогенетические деревья, реконструированные разными способами