Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2009

Семестр 7. Биоинформатика пространственных структур белков и комплексов

Расписание занятий

Результаты (Только для студентов и преподавателей!)

Экзамен

[3.1.2013] Внимание!

[ вопросы ]

Блок 1: Основы рентгеноструктурного анализа

Лекция 1: Введение в кристаллографию макромолекул (лекция)

2 октября 2012, В.Ю.Лунин

[ презентация ] [ текст ]

Практикум 1: электронная плотность, кинематическая теория рассеяния, соответствие модели экспериментальным данным

2 октября 2012, А.В.Алексеевский, С.А. Спирин, В.Ю.Лунин

[ задания ] [ PyMOL ]

Лекция 2: Введение в кристаллографию макромолекул

9 октября 2012, В.Ю.Лунин

[ презентация ] [ текст ]

Практикум 2: кристалл, группа симметрий, структурные факторы (Pymol и PDB записи)

9 октября 2012, А.В.Алексеевский, С.А. Спирин, В.Ю.Лунин

[ задания ]

Лекция 3: Введение в кристаллографию макромолекул

16 октября 2012, В.Ю.Лунин

[ презентация ] [ текст ]

Практикум 3: рассеяние на кристалле, разрешение гармоники, разрешение структуры, фазовая проблема

16 октября 2012, А.В.Алексеевский, С.А. Спирин, В.Ю.Лунин

[ задания ] [ Основные понятия о симметрии кристаллов ]

Лекция 4: показатели качества рентгеноструктурной модели

23 октября 2012, А.В.Алексеевский

[ презентация ] [ Фазы важнее интенсивностей! ] [ Ошибочная структура, статья 2012г. ]

Практикум 4: показатели качества рентгеноструктурной модели

23 октября 2012, А.В.Алексеевский

[ задания ]

Лекция 5: Структуры, решенные методом ЯМР

30 октября 2012, С.А.Спирин

[ презентация ]

Практикум 5: подготовка к коллоквиуму

30 октября 2012, А.В.Алексеевский, С.А.Спирин

[ вопросы для коллоквиума ]

Блок 2: Методы структурной биоинформатики

Лекция 6: Вторичная структура и методы ее определения

6 ноября 2012, Е.А.Аксянов

[ презентация ]

Практикум 6: коллоквиум по РСА

6 ноября 2012, С.А.Спирин

Лекция 7: Поверхности, гидрофобные ядра, структурные домены

13 ноября 2012, С.А.Спирин

[ презентация ]

Практикум 7: окончание лекции

Лекция 8: Выравнивание структур

20 ноября 2012, С.А.Спирин

[ презентация ]

Практикум 8: обсуждение результатов коллоквиума. Распределение зачётных заданий

20 ноября 2012, А.В.Алексеевский, С.А.Спирин, Е.А.Аксянов

[ зачётное задание ] [ распределение тем ]

Доклад можно будет сделать без написанного к 4му текста отчета. Оценка к экзамену будет основана на оценке за доклад.

Заявку посылать мне. ААл.

Лекция 9: Структурные мотивы, классификация укладок, гибкое выравнивание

27 ноября 2012, Е.А.Аксянов

[ презентация ]

10: Доклады студентов

4 декабря 2012, 12:45

[ порядок проведения ]

  1. Журавлева (реферат есть)
  2. Маслова (реферат есть)
  3. Братцева (перенесена до получения реферата)
  4. Сливко-Кольчик (перенесена на 11 дек)

Практикум 10: контрольная по укладкам и структурным мотивам

4 декабря 2012, А.Ал.

Примерный вид задания: дана структура без аннотации PDB; найти ее (и ее структурных гомологов) в PDB или SCOP и прочитать аннотацию.

[ задание ] [ презентация ] [ презентация_1 ] [ презентация_2 ] [ google ]

[ результаты ]

11: Доклады студентов

11 декабря 2012, 12:45

[ порядок проведения ]

  1. Сливко-Кольчик (реферат есть)
  2. Дзама (реферат есть)
  3. Свистунова (реферат есть)

11 декабря 2012, 15:20

  1. Мигур (реферат есть)
  2. Шерстюк (реферат есть)

Резерв: Нарайкина, Медведева (если останется время и будет желание выступить)

12: Доклады студентов

18 декабря 2012, 12:45

[ порядок проведения ]

Эволюция укладок

  1. Медведева (реферат есть)
  2. Золотарёва (реферат есть)
  3. Гуляева (реферат есть)

18 декабря 2012, 15:20

Предсказания

  1. Попков (реферат есть)
  2. Кузнецов (реферат есть)
  3. Нарайкина (реферат есть)

Зачёт и экзамен

[18.12.2012] Внимание: Все доклады студентов входят в зачёт и экзамен!

Рефераты доступны по ссылке "распределение тем". Если хотите исправить опечатки/ошибки, то можно прислать поправленный текст.

Если автор не хочет, что бы его реферат был открыт в интернет, то сообщите мне (ААл) [мы не у всех спросили разрешения]

На зачете преподаватель может спросить о чем был тот или иной доклад.

[ правила ]

2009/7/3d (последним исправлял пользователь tuser 2013-01-14 08:47:05)