Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2009
Семестр 7. Биоинформатика пространственных структур белков и комплексов
Результаты (Только для студентов и преподавателей!)
Экзамен
[3.1.2013] Внимание!
[ вопросы ]
Блок 1: Основы рентгеноструктурного анализа
Лекция 1: Введение в кристаллографию макромолекул (лекция)
2 октября 2012, В.Ю.Лунин
[ презентация ] [ текст ]
Практикум 1: электронная плотность, кинематическая теория рассеяния, соответствие модели экспериментальным данным
2 октября 2012, А.В.Алексеевский, С.А. Спирин, В.Ю.Лунин
Лекция 2: Введение в кристаллографию макромолекул
9 октября 2012, В.Ю.Лунин
[ презентация ] [ текст ]
Практикум 2: кристалл, группа симметрий, структурные факторы (Pymol и PDB записи)
9 октября 2012, А.В.Алексеевский, С.А. Спирин, В.Ю.Лунин
[ задания ]
Лекция 3: Введение в кристаллографию макромолекул
16 октября 2012, В.Ю.Лунин
[ презентация ] [ текст ]
Практикум 3: рассеяние на кристалле, разрешение гармоники, разрешение структуры, фазовая проблема
16 октября 2012, А.В.Алексеевский, С.А. Спирин, В.Ю.Лунин
[ задания ] [ Основные понятия о симметрии кристаллов ]
Лекция 4: показатели качества рентгеноструктурной модели
23 октября 2012, А.В.Алексеевский
[ презентация ] [ Фазы важнее интенсивностей! ] [ Ошибочная структура, статья 2012г. ]
Практикум 4: показатели качества рентгеноструктурной модели
23 октября 2012, А.В.Алексеевский
[ задания ]
Лекция 5: Структуры, решенные методом ЯМР
30 октября 2012, С.А.Спирин
[ презентация ]
Практикум 5: подготовка к коллоквиуму
30 октября 2012, А.В.Алексеевский, С.А.Спирин
Блок 2: Методы структурной биоинформатики
Лекция 6: Вторичная структура и методы ее определения
6 ноября 2012, Е.А.Аксянов
[ презентация ]
Практикум 6: коллоквиум по РСА
6 ноября 2012, С.А.Спирин
Лекция 7: Поверхности, гидрофобные ядра, структурные домены
13 ноября 2012, С.А.Спирин
[ презентация ]
Практикум 7: окончание лекции
Лекция 8: Выравнивание структур
20 ноября 2012, С.А.Спирин
[ презентация ]
Практикум 8: обсуждение результатов коллоквиума. Распределение зачётных заданий
20 ноября 2012, А.В.Алексеевский, С.А.Спирин, Е.А.Аксянов
[ зачётное задание ] [ распределение тем ]
Доклад можно будет сделать без написанного к 4му текста отчета. Оценка к экзамену будет основана на оценке за доклад.
Заявку посылать мне. ААл.
Лекция 9: Структурные мотивы, классификация укладок, гибкое выравнивание
27 ноября 2012, Е.А.Аксянов
[ презентация ]
10: Доклады студентов
4 декабря 2012, 12:45
- Журавлева (реферат есть)
- Маслова (реферат есть)
- Братцева (перенесена до получения реферата)
- Сливко-Кольчик (перенесена на 11 дек)
Практикум 10: контрольная по укладкам и структурным мотивам
4 декабря 2012, А.Ал.
Примерный вид задания: дана структура без аннотации PDB; найти ее (и ее структурных гомологов) в PDB или SCOP и прочитать аннотацию.
[ задание ] [ презентация ] [ презентация_1 ] [ презентация_2 ] [ google ]
[ результаты ]
11: Доклады студентов
11 декабря 2012, 12:45
- Сливко-Кольчик (реферат есть)
- Дзама (реферат есть)
- Свистунова (реферат есть)
11 декабря 2012, 15:20
- Мигур (реферат есть)
- Шерстюк (реферат есть)
Резерв: Нарайкина, Медведева (если останется время и будет желание выступить)
12: Доклады студентов
18 декабря 2012, 12:45
Эволюция укладок
- Медведева (реферат есть)
- Золотарёва (реферат есть)
- Гуляева (реферат есть)
18 декабря 2012, 15:20
Предсказания
- Попков (реферат есть)
- Кузнецов (реферат есть)
- Нарайкина (реферат есть)
Зачёт и экзамен
[18.12.2012] Внимание: Все доклады студентов входят в зачёт и экзамен!
Рефераты доступны по ссылке "распределение тем". Если хотите исправить опечатки/ошибки, то можно прислать поправленный текст.
Если автор не хочет, что бы его реферат был открыт в интернет, то сообщите мне (ААл) [мы не у всех спросили разрешения]
На зачете преподаватель может спросить о чем был тот или иной доклад.
[ правила ]