2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Практические занятия к курсу "Молекулярное Моделирование Биополимеров"
Новые варианты лекций вместе с исходной разметкой в LaTex (без) можно посмотреть тут: http://kodomo.fbb.msu.ru/~golovin/mmlectures/
Правила сдачи зачёта
Связи с тем, что практикум предполагает использование суперкомпьютера и время доступа ограничено, то ожидается, что к этому моменту студенты будут знакомы с материалом. Для достижения этого результата необходим контроль за исполнением заданий. Итак:
- Если сумма баллов за практикумы менее 0.666 от максимальной, то студент получает дополнительнo на зачёте.
Жду рациональных предложений по улучшению курса.
Очередь проверки работ
https://forms.gle/nPci3AVp7XB8sLJJ9
Результаты практической работы
Результаты доступны в виде google таблицы. Из таблицы видно как оцениваются задания.
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1HCS9RVg8YLxr86cAk9C0Kpf1eLoGSFF9ceJkA6to6tY/edit?usp=sharing
scores: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1MOAnOR5KZXIQCinGCv6sczP9BmQQOf29SBPtptBmyWo/edit?usp=sharing
1. Знакомство с Pymol
13 февраля 2020, А.В.Головин. [задания] [презентация]
2. Работа Pymol
28 февраля 2020, А.В.Головин. [задания]
3. Хемоинформатика
3 марта 2020, А.В.Головин. [задания]
4. Ab initio вычисления орбиталей водорода
6 марта 2020, А.В.Головин. [задания]
5. Ab initio вычисление молекулы водорода
13 марта 2020, А.В.Головин. [задания]
6. Вычисление ковалентных параметров для молекулярной механики
20 марта 2019, А.В.Головин. [задания]
7. Изучение работы методов контроля температуры в молекулярной динамике
27 марта 2020, А.В.Головин. [задания]
8. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
10 апреля 2020, А.В. Головин [задания]
9. Молекулярный докинг
17 апреля 2020, А.В. Головин [задания]
10. Макромолекулярный докинг
24 апреля 2020, А.В. Головин [задания]
11. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS
8 мая 2020, А.В. Головин [задания]
12. Анализ молекулярной динамики биологических молекул в GROMACS
15 мая 2020, А.В. Головин [задания]