Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2019
Семестр 1
Результаты Только для студентов и преподавателей
Записаться в очередь на проверку
Заполните эту форму при выполнении всех обязательных заданий практикума. Дата заполнения формы автоматически фиксируется как дата выполнения заданий
Список записавшихся в очередь на проверку
Эксперимент с рассказом ответа на вопрос однокурсникам сочтен успешным. Создал формы для следующих заданий. — ААл
Кто мне рассказал сообщение по заданию 3 практикума 11
Таблица кто кому рассказал идет в зачёт :)
Информация
26 дек 2019
В связи с форсмажором на зачете 27го меня не будет с 11 час.
Появлюсь около 15 час, меня можно будет найти и даже досдать что-нибудь. Ведомость будет у меня.
Советую должникам по блоку 3 из обеих групп прийти на 1ю пару.
- ААл
25 дек 2019 Ведомость блока 3 отражает результаты проверки на сегодня. До зачёта в пятницу будут проверяются только те исправления, о которых есть своевременные сообщения в очереди. Первыми поверяются исправления, от которых зависит зачёт блока. ААл
Блок 1: Файловая система. bash. Геном как файл.
1. Знакомство. Что такое биоинформатика?
6 сентября
А. Алексеевский, С. Исаев, С.А. Спирин, А.О. Залевский, И.С. Русинов и другие
[ Бывает ли у клеток индивидуальность? AAl ] [ Чем занимаются биоинформатики. SI ]
[ задания ] [ подсказки ] [ комментарии при проверке ] [ комментарии про wiki ]
2. Внутренности компьютера. Организация работы в компьютерном классе.
14 сентября
А.О. Залевский, А.В. Алексеевский, И.С. Русинов
[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ]
3. Знакомство с GNU/Linux и CLI
20 сентября 2019
А. Залевский, А. Злобин, Т. Шугаева, И. Русинов, А. Алексеевский
[презентация] [challenge] [учебник] по Bash для начинающих (рус.)
[ задания от ААл ] [ подсказки ААл ]
Чуть-чуть про Vim для любопытных
Очень хороший курс по Bash - курс от Институт биоинформатики. Местами он сложноват. Зато там есть много чего интересного есть, например основы работы с vim:) (ПДД)
ne, the nice editor - еще один редактор, на kodomo его нет, к сожалению. Но можете использовать на своих компьютерах.
4. Знакомство с GNU/Linux и CLI. Файловая система. Потоки ввода/вывод.
27 сентября 2019
А. Залевский, Т. Шугаева, М. Мальков, В. Маслова, И. Русинов
5. Знакомство с GNU/Linux и CLI. Текстовые редакторы. Скрипты. Права.
4 октября 2019
А. Залевский, Т. Шугаева, М. Мальков, В. Маслова, И. Русинов
Блок 2: Язык программирования Python
6. Простейшие типы данных и действия с ними
11 октября
С.А. Спирин, Д. Пензар, И.С. Русинов, А. Зинкевич
[лекция_ПДД_1вариант, ipynb] [лекция_ПДД_1вариант, html]
[лекция_ПДД_2вариант, ipynb] [лекция_ПДД_2вариант, html]
7. Условный оператор, списки, циклы, файлы
18 октября
С.А. Спирин, Д. Пензар, И.С. Русинов, А. Зинкевич
8. Модули, исключения
25 октября
С.А. Спирин, Д. Пензар, И.С. Русинов, А. Зинкевич
[задания] [помощь] [дополнительное задание до конца блока] [лекция_ПДД, ipynb] [лекция_ПДД, html]
9. Интернет, словари, кортежи, функции
1 ноября
С.А. Спирин, Д. Пензар, И.С. Русинов, А. Зинкевич
[лекция_ПДД, ipynb] [лекция_ПДД, html]
10. Итоговая контрольная
8 ноября
задание для П1 и П2 задание для П3 и П4
Блок 3: Использование электронных таблиц (ЭТ) для анализа данных
А.Алексеевский, А.Ершова (удаленно) и др.
Для зачёта блока необходимо получить
зачёт по умениям работы с ЭТ
[помощь] [правила цитирования]
11. Биологические данные для обзора
15 ноября 2019
А.Алексеевский, А.Залевский, В.Маслова, И.Дианкин
[кому какая бактерия] [презентация] [задания] [кто кому рассказывает]
С колонкой strand в которой стоят либо +, либо –, могут возникнуть проблемы. Совет: с помощью функции ЕСЛИ (IF) в новой колонке поставьте 1, если + и –1, если –. Потом эти значения скопируйте в колонку strand с помощью Специальной вставки → Значения. Избежите неприятностей при копировании этой колонки и вам зачтется функция ЕСЛИ и Специальная вставка :).
И так поступить правильно по существу, потому что "минус на минус будет плюс" В моих файлах strand кодируется только +1 или –1.
— ААл
12. Приёмы работы в электронных таблицах
22 ноября 2019
С.А.Спирин
13. Гистограммы
29 ноября 2019
С.А.Спирин, А.Злобин
14. Коллоквиум по умениям в Excel
6 декабря 2019
С.А.Спирин и все остальные
[задания по умениям для коллоквиума]
15. Еще раз про обзоры
13 декабря 2019
А.Алексеевский, А.Залевский
[комментарии при проверке] для учета их при исправлении обзоров
16. Досдача долгов
20 декабря 2019
Задания для контрольных (в 207):
"кому я должен рассказать"