Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2019

Семестр 1

Расписание

Результаты Только для студентов и преподавателей


Записаться в очередь на проверку

Заполните эту форму при выполнении всех обязательных заданий практикума. Дата заполнения формы автоматически фиксируется как дата выполнения заданий

Список записавшихся в очередь на проверку


Задать вопрос преподавателям

Посмотреть ответы на вопросы


Эксперимент с рассказом ответа на вопрос однокурсникам сочтен успешным. Создал формы для следующих заданий. — ААл

Кто мне рассказал сообщение по заданию 3 практикума 11

Таблица кто кому рассказал идет в зачёт :)


Информация


26 дек 2019

В связи с форсмажором на зачете 27го меня не будет с 11 час.

Появлюсь около 15 час, меня можно будет найти и даже досдать что-нибудь. Ведомость будет у меня.

Советую должникам по блоку 3 из обеих групп прийти на 1ю пару.

  • ААл

25 дек 2019
Ведомость блока 3 отражает результаты проверки на сегодня.

До зачёта в пятницу будут проверяются только те исправления, о которых есть своевременные сообщения в очереди. 
Первыми поверяются исправления, от которых зависит зачёт блока.

   ААл


Блок 1: Файловая система. bash. Геном как файл.

1. Знакомство. Что такое биоинформатика?

6 сентября

А. Алексеевский, С. Исаев, С.А. Спирин, А.О. Залевский, И.С. Русинов и другие

[ Бывает ли у клеток индивидуальность? AAl ] [ Чем занимаются биоинформатики. SI ]

[ задания ] [ подсказки ] [ комментарии при проверке ] [ комментарии про wiki ]

2. Внутренности компьютера. Организация работы в компьютерном классе.

14 сентября

А.О. Залевский, А.В. Алексеевский, И.С. Русинов

[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ]

3. Знакомство с GNU/Linux и CLI

20 сентября 2019

А. Залевский, А. Злобин, Т. Шугаева, И. Русинов, А. Алексеевский

[презентация] [challenge] [учебник] по Bash для начинающих (рус.)

[ задания от ААл ] [ подсказки ААл ]

Чуть-чуть про Vim для любопытных

Очень хороший курс по Bash - курс от Институт биоинформатики. Местами он сложноват. Зато там есть много чего интересного есть, например основы работы с vim:) (ПДД)

ne, the nice editor - еще один редактор, на kodomo его нет, к сожалению. Но можете использовать на своих компьютерах.

4. Знакомство с GNU/Linux и CLI. Файловая система. Потоки ввода/вывод.

27 сентября 2019

А. Залевский, Т. Шугаева, М. Мальков, В. Маслова, И. Русинов

[задания]

5. Знакомство с GNU/Linux и CLI. Текстовые редакторы. Скрипты. Права.

4 октября 2019

А. Залевский, Т. Шугаева, М. Мальков, В. Маслова, И. Русинов

[задания]

Блок 2: Язык программирования Python

6. Простейшие типы данных и действия с ними

11 октября

С.А. Спирин, Д. Пензар, И.С. Русинов, А. Зинкевич

[задания] [помощь]

[лекция_ПДД_1вариант, ipynb] [лекция_ПДД_1вариант, html]

[лекция_ПДД_2вариант, ipynb] [лекция_ПДД_2вариант, html]

7. Условный оператор, списки, циклы, файлы

18 октября

С.А. Спирин, Д. Пензар, И.С. Русинов, А. Зинкевич

[задания] [помощь]

[лекция_ПДД, ipynb]

[лекция_ПДД, файлы к ipynb, скопировать в одну директорию с .ipynb, чтобы иметь возможность запускать примеры с чтением и дозаписью в файл]

[лекция_ПДД, html]

8. Модули, исключения

25 октября

С.А. Спирин, Д. Пензар, И.С. Русинов, А. Зинкевич

[задания] [помощь] [дополнительное задание до конца блока] [лекция_ПДД, ipynb] [лекция_ПДД, html]

9. Интернет, словари, кортежи, функции

1 ноября

С.А. Спирин, Д. Пензар, И.С. Русинов, А. Зинкевич

[задания] [помощь]

[лекция_ПДД, ipynb] [лекция_ПДД, html]

10. Итоговая контрольная

8 ноября

задание для П1 и П2 задание для П3 и П4


В пятницу 20 декабря в классе 207 можно будет переписать зачётные контрольные по второму блоку.

Старые варианты здесь: [ вторая ], [ третья ], [ итоговая ].

20-го задания будут аналогичные по трудности и необходимым умениям.


Блок 3: Использование электронных таблиц (ЭТ) для анализа данных

А.Алексеевский, А.Ершова (удаленно) и др.

Для зачёта блока необходимо получить

[помощь] [правила цитирования]

11. Биологические данные для обзора

15 ноября 2019

А.Алексеевский, А.Залевский, В.Маслова, И.Дианкин

[кому какая бактерия] [презентация] [задания] [кто кому рассказывает]

С колонкой strand в которой стоят либо +, либо –, могут возникнуть проблемы. Совет: с помощью функции ЕСЛИ (IF) в новой колонке поставьте 1, если + и –1, если –. Потом эти значения скопируйте в колонку strand с помощью Специальной вставки → Значения. Избежите неприятностей при копировании этой колонки и вам зачтется функция ЕСЛИ и Специальная вставка :).

И так поступить правильно по существу, потому что "минус на минус будет плюс" В моих файлах strand кодируется только +1 или –1.

— ААл

12. Приёмы работы в электронных таблицах

22 ноября 2019

С.А.Спирин

13. Гистограммы

29 ноября 2019

С.А.Спирин, А.Злобин

[ Как сделать гистограмму ]

14. Коллоквиум по умениям в Excel

6 декабря 2019

С.А.Спирин и все остальные

[задания по умениям для коллоквиума]

15. Еще раз про обзоры

13 декабря 2019

А.Алексеевский, А.Залевский

[комментарии при проверке] для учета их при исправлении обзоров

[презентация]

16. Досдача долгов

20 декабря 2019

Задания для контрольных (в 207):

вторая

третья

финальная