Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2023
Структуры и последовательности нуклеиновых кислот
Результаты Только для студентов и преподавателей
Записаться в очередь на проверку
Блок 1: Пространственные структуры нуклеиновых кислот
1. Нуклеиновые кислоты, строение и структура (лекция)
3 сентября 2024, А.В. Головин
[ презентация ]
2. Мини-контрольная. Химическое строение нуклеиновых кислот
10 сентября 2024, А.В. Головин
3. A- и В- формы ДНК. Структура РНК
17 сентября 2024, А.В. Головин.
[ задания ] [ подсказки ] [ ipynb ]
4. Комплексы ДНК-белок
24 сентября 2024, А.В. Головин
[ задания ] [ подсказки ] [ задания-jupyter ]
5. Итоговая контрольная
1 октября 2024, А.В. Головин
Блок 2: Последовательности нуклеиновых кислот
6. Секвенирование по Сэнгеру
8 октября 2024, Е.Рюмина
[ презентация ] [ задание ]
7. Нуклеотидные банки данных
15 октября 2024, Д. Диброва
[ презентация ] [ задания ]
8. Нуклеотидный BLAST
22 октября 2024, Д. Диброва
[ презентация ] [ задания ] [ подсказки и советы ]
9. EMBOSS, Entrez Direct, NCBI Datasets
29 октября 2024, И. Русинов
[ презентация ] [ задания ] [ видеозапись с 2021 года ]
10. Поиск в нуклеотидных банках по аннотации. Выравнивание геномов
5 ноября 2024, С.А. Спирин
[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ]
Блок 3. Сборка и анализ геномов
11. Введение в анализ NGS
12 ноября 2024, Анастасия Жарикова
[ презентация ]
[ правила для домашнего задания ]
12. NGS - анализ экзомов
19 ноября 2024, Анастасия Жарикова
[ презентация ]
13. NGS — организация кода
26 ноября 2024, Анастасия Жарикова
[ презентация ]
[ Примеры организации кода (коллоквиум - вопрос 6) ]
14. Сборка de novo
3 декабря 2024, С.А.Спирин
[ презентация ] [ задание ]
15. NGS — анализ транскриптомов
10 декабря 2024, Анастасия Жарикова
[ презентация ]
16. Коллоквиум
17 декабря 2024
[ программа ]
[ задание для выполнения в день лекции ] [ Программа NPG-explorer: инструкция и сайт для скачивания ]