[Показать меню]

• 2024
• 2023
• 2022
• 2021
• 2020
• 2019
• 2018
• 2017

• ...

Семестр 1. Объекты и инструменты, первое знакомство

Расписание

Результаты Только для студентов и преподавателей

При проблемах доступа к ведомости пишите на valmarfgecnf@gmail.com. Пожалуйста, указывайте своё имя в письме.

Записаться в очередь на проверку

Заполните эту форму при выполнении всех обязательных заданий практикума. Дата заполнения формы автоматически фиксируется как дата выполнения заданий

Список записавшихся в очередь на проверку

Блок 1: Знакомство, настройка учётных записей, первые задания

1. Знакомство.

5 сентября 2025

[ домашнее задание на 12 сентября ] [ Вводная лекция (С.А.С.) ] [ Вводная лекция (ДД) ]

2. Геномы.

12 сентября 2025

С.А. Спирин, И.С. Русинов, Д.В. Диброва, Ю.А. Алешина

[ презентация (И. Русинов) ] [ презентация (С.А. Спирин) ]

[ задания ] [ подсказки ]

Блок 2: Командная строка Linux

3. Bash. SSH. Работа с файлами.

19 сентября 2025

И. Русинов, Р. Ириоглов, И. Ильницкий, С.А. Спирин

[ презентация (И. Ильницкий) ] [ презентация (И. Русинов, только bash и SSH) ] [ упражнения ] [ задания ]

4. SFTP, спец. символы bash, текстовые файлы.

26 сентября 2025

И. Русинов, Р. Ириоглов, И. Ильницкий, С.А. Спирин

[ презентация (И. Ильницкий) ] [ упражнения ] [ задания ]

5. Потоки ввода/вывода, работа с текстом.

3 октября 2025

И. Русинов, Р. Ириоглов, И. Ильницкий, С.А. Спирин

[ презентация (И. Ильницкий) ] [ упражнения ] [ задания ] [ подсказки ]

6. Коллоквиум.

10 октября 2025

И. Русинов, Р. Ириоглов, И. Ильницкий, С.А. Спирин и другие

[ список тем ]

Блок 3: Электронные таблицы

Обращаем ваше внимание на то, что работы этого блока не могут быть проверены, если вы не предоставили доступ к своим таблицам!

7. Импорт данных, базовые понятия и навыки

17 октября 2025

Е. Рюмина, С.А. Спирин, А.В Алексеевский, Р. Ириоглов, Ю. Алёшина

[ презентация (А.В.Алексеевский) ] [ презентация (Е.Д. Рюмина) ]

[ задание для выполнения во время занятия ] [ объяснения, как выполнить задание ]

[ домашнее задание на 24 октября ]

8. Другие методы ЭТ. Мини-обзор генома бактерий: темы

24 октября 2023

Е. Рюмина, С.А. Спирин, А.В Алексеевский, Р. Ириоглов

[ презентация (А.В.Алексеевский) ]

[ Задание для выполнения во время занятия ] [ объяснения как выполнить задание 1 ]

[ домашнее задание на 31 октября ] [ выполнение каких заданий достаточно для зачёта пр. 8 и блока 3 ]

Блок 4: Программирование на Python

9. Базовый Python

31 октября 2025

Владимир Ноздрин, Дмитрий Босов, Даниил Хлебников, Алексей Школиков

[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ]

Дедлайн: 7 ноября 8:59. Обязательных заданий: 8

10. f-строки. Условные конструкции и цикл for.

7 ноября 2025

Владимир Ноздрин, Алексей Школиков, Даниил Хлебников, Дмитрий Звездин

[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ]

Дедлайн: 14 ноября 8:59. Обязательных заданий: 8.

11. Цикл while. Списки.

14 ноября 2025

Владимир Ноздрин, Алексей Школиков, Даниил Хлебников, Дмитрий Звездин

[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ]

Дедлайн: 21 ноября 8:59. Обязательных заданий: 10

12. Словари. Множества.

21 ноября 2025

Владимир Ноздрин, Елизавета Аристова, Даниил Хлебников, Дмитрий Звездин

[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ]

Дедлайн: 28 ноября 8:59. Обязательных заданий: 8

13. Small talk о мини-обзоре. Модули. Файлы: чтение.

28 ноября 2025

Владимир Ноздрин, Дмитрий Босов, Даниил Хлебников, Дмитрий Звездин

[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ]

Дедлайн: 5 декабря 8:59. Обязательных заданий: 8.

Блок 5: Мини-обзор

Студент пишет обзор того что, успел узнать о выбранной бактерии, её геноме, генах и белках. Он отвечает за то, что написал текст самостоятельно, и за то, что в источниках, на которые он ссылается, написано именно то, что взято в текст мини-обзора из источника

ААл

Мини-обзор должен быть готов к понедельнику 8 декабря. Это значит, что к полуночи с 7 на 8 декабря на вашей вики-странице должна появиться ссылка на pdf с обзором, и вы запишетесь в очередь на проверку (пункт mini_review). Начиная с раннего утра 8 декабря преподаватели будут читать ваши обзоры. 12 декабря каждый студент, сдавший обзор вовремя, должен будет "защитить" свою работу, а именно, побеседовать с прочитавшим его обзор преподавателем, ответить на вопросы, выслушать замечания.

[ Содержание мини-обзора ]

[ Структура мини-обзора ]

[ Немного о правилах оформления печатного текста (САС) ]

[ Шаблоны оформления статей ]
Другие шаблоны можно найти на сайтах журналов, например:"BMC Bioinformatics", "Journal of Computational Biology", "PLoS Computational Biology", "Briefings in Bioinformatics", ... Рекомендуется ориентироваться на какой-нибудь из образцов: порядок и форматирование разделов, оформление таблиц, рисунков, списка литературы и ссылок на литературу.