2025
2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
Семестр 1. Объекты и инструменты, первое знакомство
Результаты Только для студентов и преподавателей
При проблемах доступа к ведомости пишите на valmarfgecnf@gmail.com. Пожалуйста, указывайте своё имя и логин в письме.
Записаться в очередь на проверку
Заполните эту форму при выполнении всех обязательных заданий практикума. Дата заполнения формы автоматически фиксируется как дата выполнения заданий
Список записавшихся в очередь на проверку
Порядок сдачи и зачёта практикумов
Блок 1: Знакомство, настройка учётных записей, первые задания
1. Знакомство
4 сентября 2026
И.С. Русинов, С.А. Спирин, Д.Д. Диброва
[ Вводная лекция (С.А.С.) ] [ Вводная лекция (ДД) ] [ домашнее задание на 12 сентября ]
2. Геномы
11 сентября 2026
С.А. Спирин, И.С. Русинов, Р. Ириоглов, М. Корлякова
[ презентация (ИР) ] [ задания ] [ подсказки ]
Блок 2: Командная строка Linux
3. Bash. SSH. Работа с файлами.
19 сентября 2025
И. Русинов, Р. Ириоглов, И. Ильницкий, С.А. Спирин
[ презентация (И. Ильницкий) ] [ презентация (И. Русинов, только bash и SSH) ] [ упражнения ] [ задания ]
4. SFTP, спец. символы bash, текстовые файлы.
26 сентября 2025
И. Русинов, Р. Ириоглов, И. Ильницкий, С.А. Спирин
[ презентация (И. Ильницкий) ] [ упражнения ] [ задания ]
5. Потоки ввода/вывода, работа с текстом.
3 октября 2025
И. Русинов, Р. Ириоглов, И. Ильницкий, С.А. Спирин
[ презентация (И. Ильницкий) ] [ упражнения ] [ задания ] [ подсказки ]
6. Коллоквиум.
10 октября 2025
И. Русинов, Р. Ириоглов, И. Ильницкий, С.А. Спирин и другие
[ список тем ]
Блок 3: Электронные таблицы
Обращаем ваше внимание на то, что работы этого блока не могут быть проверены, если вы не предоставили доступ к своим таблицам!
7. Импорт данных, базовые понятия и навыки
17 октября 2025
Е. Рюмина, С.А. Спирин, А.В Алексеевский, Р. Ириоглов, Ю. Алёшина
[ презентация (А.В.Алексеевский) ] [ презентация (Е.Д. Рюмина) ]
[ задание для выполнения во время занятия ] [ объяснения, как выполнить задание ]
[ домашнее задание на 24 октября ]
8. Другие методы ЭТ. Мини-обзор генома бактерий: темы
24 октября 2023
Е. Рюмина, С.А. Спирин, А.В Алексеевский, Р. Ириоглов
[ презентация (А.В.Алексеевский) ]
[ Задание для выполнения во время занятия ] [ объяснения как выполнить задание 1 ]
[ домашнее задание на 31 октября ] [ выполнение каких заданий достаточно для зачёта пр. 8 и блока 3 ]
Блок 4: Программирование на Python
9. Базовый Python
31 октября 2025
Владимир Ноздрин, Дмитрий Босов, Даниил Хлебников, Алексей Школиков
[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ]
Дедлайн: 7 ноября 8:59. Обязательных заданий: 8
10. f-строки. Условные конструкции и цикл for.
7 ноября 2025
Владимир Ноздрин, Алексей Школиков, Даниил Хлебников, Дмитрий Звездин
[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ]
Дедлайн: 14 ноября 8:59. Обязательных заданий: 8.
11. Цикл while. Списки.
14 ноября 2025
Владимир Ноздрин, Алексей Школиков, Даниил Хлебников, Дмитрий Звездин
[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ]
Дедлайн: 21 ноября 8:59. Обязательных заданий: 10
12. Словари. Множества.
21 ноября 2025
Владимир Ноздрин, Елизавета Аристова, Даниил Хлебников, Дмитрий Звездин
[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ] [ Ответы на летучку 1 ]
Дедлайн: 28 ноября 8:59. Обязательных заданий: 8
13. Small talk о мини-обзоре. Модули. Файлы: чтение.
28 ноября 2025
Владимир Ноздрин, Дмитрий Босов, Даниил Хлебников, Дмитрий Звездин
[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ] [ Ответы на летучку 2 ]
Дедлайн: 5 декабря 8:59. Обязательных заданий: 8.
14. Файлы: чтение, запись, парсинг. Простейшие графики
5 декабря 2025
Владимир Ноздрин, Дмитрий Босов, Даниил Хлебников, Алексей Школиков
[ Лекция в Colab ][ Домашнее задание в системе ejudge ] Дедлайн: 18 декабря 23:59. Обязательных заданий: 6.
[ Домашнее задание, часть 2. (a.k.a. практикум 14) ] Выкладывайте к себе на wiki-страницу и записывайтесь в очередь. Дедлайн: 17 декабря 23:59.
Блок 5: Мини-обзор
Студент пишет обзор того что, успел узнать о выбранной бактерии, её геноме, генах и белках. Он отвечает за то, что написал текст самостоятельно, и за то, что в источниках, на которые он ссылается, написано именно то, что взято в текст мини-обзора из источника
ААл
Мини-обзор должен быть готов к понедельнику 8 декабря. Это значит, что к полуночи с 7 на 8 декабря на вашей вики-странице должна появиться ссылка на pdf с обзором, и вы запишетесь в очередь на проверку (пункт mini_review). Начиная с раннего утра 8 декабря преподаватели будут читать ваши обзоры. 12 декабря каждый студент, сдавший обзор вовремя, должен будет "защитить" свою работу, а именно, побеседовать с прочитавшим его обзор преподавателем, ответить на вопросы, выслушать замечания.
[ Содержание мини-обзора ]
[ Структура мини-обзора ]
[ Немного о правилах оформления печатного текста (САС) ]
[ Шаблоны оформления статей ]
Другие шаблоны можно найти на сайтах журналов, например:"BMC Bioinformatics", "Journal of Computational Biology", "PLoS Computational Biology", "Briefings in Bioinformatics", ... Рекомендуется ориентироваться на какой-нибудь из образцов: порядок и форматирование разделов, оформление таблиц, рисунков, списка литературы и ссылок на литературу.