Четвёртый семестр:

Блок 1: Молекулярная филогения

Подзадачи:

• Филогенетическое дерево
• Укоренение и бутстрэп

Блок 2: Профили, сигналы и эволюционные домены

Подзадачи:

• MEME!!!1
• Мотивы в белках. PSSM и паттерны. PSI-BLAST. Банк Prosite
• PFAM. HMM домены
• Профиль целевого семейства. Поиск порога. ROC - кривая

Блок 3: Функциональные классы белков

Подзадачи:

• Ферменты и метаболические пути. Работа с базой данной KEGG.
• Геномное окружение. Работа с базой данной GO.
• Положение относительно мембраны. Работа с базой данной OPM.

Вернуться назад.

©Solonovich Vera,2017