Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2011
Семестр II. Последовательности белков
Расписание (проект)
Результаты (Только для студентов и преподавателей!)
Блок 1: Банки данных
1. linux
Д.Кирсанов, А.Алексеевский
2. Uniprot/Swissprot
А.Алексеевский, Д.Кирсанов
[задания] [описания полей] [Uniprot documentation] [презентация]
3. Поисковые системы
А.Алексеевский, Д.Кирсанов
4. Поисковая система Pubmed
Е.Аксянов, А.Алексеевский
!! Внимание: [о ссылках].
Блок 2: Выравнивание белковых последовательностей
5. Понятие о выравнивании. Эволюционное выравнивание.
С.Виноградова, А.Артемов, А.Алексеевский
[задания] [презентация] [редактор выравниваний Gendoc]
6. Программы парного выравнивания.
А.Артемов, С.Виноградова, А.Алексеевский
[задания] [презентация] [handout]
7. Программа BLAST
С.Виноградова, А.Артемов, А.Алексеевский
8. Множественное выравнивание
А.Артемов, С.Виноградова, А.Алексеевский
[задания] [JalView] [презентация]
Блок 3: Семейства белков
9. Паттерны и банк Prosite
С.Спирин
10. Эволюционные домены
С.Спирин
11. Мотивы. MEME, MAST
С.Виноградова, А.Артемов, С.Спирин
12. PSI-BLAST
С.Спирин
[задания] [подсказки] [презентация]
13. Контрольная работа
С.Спирин
14. Пересдача контрольной работы
С.Спирин