2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017В процессе ...
Отчёты о выполненных заданиях должны быть на веб-страничках. Допустима ссылка на файл с отчетом.
Для работы со структурами надо использовать PyMol.
Отчёт по анализу качества расшифровки структуры
Список умений, входящих в зачет
- Построение и визуализация электронной плотности для PDB файла
- Файл структурных факторов из PDB
- Восстановление координат атомов по структурным факторам и фазам в 1D(анализ Фурье)
- Восстановление соседних ячеек
- Интерпретация особенностей РСА структур (occupancy, altercode, B-фактор, пропущенные остатки и т.п.)
- Интерпретация ЯМР структур
- Биологическая единица
- Определение вторичной структуры: DSSP или Stride; SheeP
- Определение типичных укладок и мотивов в структуре белка
- Пространственное совмещение
- Нахождение гидрофобных кластеров: CluD
- Построение поверхности, раскраска по заряду: pymol
- Структурная классификация: SCOP