Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2012

Семестры Студенты Преподаватели

• 2024
• 2023
• 2022
• 2021
• 2020
• 2019
• 2018
• 2017

• ...

Семестр 7. Биоинформатика 3D структур

Расписание

Результаты (Только для студентов и преподавателей!)

Список заданий на семестр

Как получить зачёт

Очередь на проверку

Состояние очереди

Про экзамен: что надо сдать, вопросы по 3D, как ставятся оценки и проч.

экзамен

Новости

18 декабря: выложены билеты к экзамену 8 января по весенней части курса "Алгоритмы биоинформатики".

30 нояб. Опубликовано задание по анализу качества своего белка (см. пункт 7)
30 нояб. Опубликован предварительный список вопросов к коллоквиуму.  
25 нояб. Опубликованы задания по блоку 2.
25 нояб. Опубликованы темы для журнального клуба.

Прим. Символ ангстрема в HTML пишется так: Å .

Журнальный клуб

[темы] [программа]

Заявки на журнальный клуб присылайте на evaksianov@gmail.com .

Расписание журнального клуба:

• Понедельник 7 декабря 15:30 ауд. 207 (группа 401) и 208 (группа 402)
• Среда 9 декабря 10:55 ауд. 207 (группа 401) и 208 (группа 402)
• Пятница 11 декабря 12:45 ауд. 403 (группа 401) и 208 (группа 402)
• Понедельник 14 декабря 15:30 ауд. 207 (группа 401) и 208 (группа 402)
• Среда 16 декабря 10:55 ауд. 207 (группа 401) и 208 (группа 402)
• Пятница 18 декабря 12:45 ауд. 403 (группа 401) и 208 (группа 402)

Каждый день по 6 докладов (по 3 в каждой группе). Желательно определиться с ними на этой неделе (по 3 докладчика и 3 оппонента из каждой группы на каждый день).

Блок 1. РСА

1. Лекция 1

7 октября 2015, В.Ю. Лунин

[презентация]

2. Семинар 1

9 октября 2015, А.В. Алексеевский, С.А.Спирин

[задание] [разъяснение]

3. Лекция 2

14 октября 2015, В.Ю. Лунин

[презентация]

4. Семинар 2

16 октября 2015, А.В. Алексеевский, С.А.Спирин

[задание: восстановление ЭП] [задание: восстановление кристалла]

5. Лекция 3

21 октября 2015, В.Ю. Лунин

[презентация]

6. Семинар 3

23 октября 2015, Е.А. Аксянов, А.В. Алексеевский, С.А.Спирин

[задание: изучить файл структурных факторов]

7. Лекция 4: Validation

30 октября 2015, А.Алексеевский

[презентация] [задание] [указания]

8. Лекция 5: ЯМР расшифовки структуры

[презентация] [задание]

9. Коллоквиум по РСА

11 ноября (401 группа) и 13 ноября (402 группа)

[вопросы]

На семинаре в одной из групп я не успел подробно рассмотреть фазовую проблему. Так что вот вам популярный конспект.

Блок 2. Анализ трехмерных структур

Список заданий по блоку

10-13. Анализ трехмерных структур.

• 18 ноября. Вторичные структуры.
• 20 ноября. Пространственное совмещение (начало).
• 25 ноября. Пространственное совмещение (продолжение). Структурные классификации.
  • Е. Аксянов.

[ презентация ]

• 27 ноября. Гидрофобные ядра. Структурные домены. Поверхность макромолекулы.
  • С.А. Спирин

[ презентация (гидрофобные ядра) ] [ презентация (домены) ] [ презентация (поверхность) ]

• 2 и 4 декабря занятий по биоинформатике не будет. Журнальный клуб начинается в понедельник 7 декабря в 15:30 (см. расписание выше).