Четвертый семестр

Здесь вы можете ознакомиться с выполненией заданий по крусу практическая информатика, перейдя по ссылкам ниже. Часть отчетов по заданиям оформлена в виде html-страниц. Номера практик соответствуют хронологическому порядку.

• БЛОК 1: Молекулярная филогения.
1. Что такое филогенетическое дерево?
2. Реконструкция филогении
3. Укоренение и бутстрэп
• БЛОК 2: Профили, сигналы и эволюционные домены
1. Сигналы, мотивы, PWM
2. Мотивы в белках. PSSM и паттерны. PSI-BLAST. Банк Prosite
3. Домены. Pfam. HMM профиль.
4. ROC-кривая.
• БЛОК 3: Функциональные классы белков
1. Ферменты и метаболические пути. База данных KEGG.
2. Геномное окружение. База данных GO
3. Трансмембранные белки