Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2015

Последовательности и структуры нуклеиновых кислот


Результаты Только для студентов и преподавателей

Расписание

Записаться в очередь на проверку

Состояние очереди


Новости

23 янв 2017

Коллеги, не получившие зачёт.

Напоминаю, что на зачёт в феврале надо приходить со всеми выполненными обязательными заданиями!

  • ААл

3 дек
Проверяю задания по карте локального сходства. Не все умеют в уме представить себе, что произойдет при изменении начал последовательностей в карте сравнения кольцевых хромосом.

Происходит вот что. Напечатаем карту и вырежем из бумаги. Изменение начал равносильно следующим операциям.
1. Отрежем полоску слева и приклеим ее справа.
2. Отрежем полоску сверху и приклеим снизу.   

Такими манипуляциями часто можно упростить карту!

              ААл

Практикум 6: работы, выполненные после 25 окт. проверяются только на зачёте.

Практикум 7: работы, выполненные после 4 нояб.(срок продлен из-за сбоя серевера 31 окт) проверяются только на зачёте

Практикум 8: срок сдачи без потери баллов - 4 нояб(срок продлен из-за сбоя серевера 31 окт);работы, выполненные после 15 нояб. проверяются только на зачёте.

Практикум 9: срок сдачи без потери баллов - 15 нояб;работы, выполненные после 22 нояб., проверяются только на зачёте.

ААл

11 октября прекращается проверка всех работ по первому блоку


Блок 1: Пространственные структуры нуклеиновых кислот

1. Нуклеиновые кислоты, строение и структура (лекция)

6 сентября 2016, А.В. Головин

[ презентация ]

2. Мини-контрольная. Химическое строение нуклеиновых кислот

13 сентября 2016, А.В. Головин

[ задания ] [ подсказки ]

3. A- и В- формы ДНК. Структура РНК

20 сентября 2016, А.В. Головин.

[ задания ] [ подсказки ]

4. Комплексы ДНК-белок

27 сентября 2016, А.В. Головин.

[ задания ] [ подсказки ]

5. Итоговая контрольная

4 октября 2016, А.В.Головин


Блок 2: Последовательности нуклеиновых кислот

6. Прочтение последовательностей по Сэнгеру

11 окт 2016, А.Алексеевский, проверяют преподаватели и студенты старших курсов

[ презентация ] [ задания ]

7. Нуклеотидные банки данных

18 окт 2016, А.Алексеевский, А.Ершова

[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ]

8. Поиск по сходству (нуклеотидный blast)

25 окт 2016, А.Алексеевский, Д.Диброва, А.Ершова

[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ]

9. EMBOSS. Выравнивание геномов

1 ноя 2016, А.Алексеевский, Д.Диброва, А.Ершова

[ презентация EMBOSS ] [ презентация выравнивание геномов ]

[ задания ] [ подсказки по EMBOSS ] подсказки по выравниваниям геномов ]

10. Коллоквиум

8 нояб 2016, все

[вопросы для подготовки]


Блок 3: Предсказание генов

Срок сдачи практикумов 11 и 12 общий: 29 ноября 2016 г.

Срок закрытия проверки блока до зачета: 6 декабря 2016 г.

11. Предсказание генов прокариот

15 ноября 2016, Д.Диброва, А.Ершова

[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ] [ плазмиды ]

12. Предсказание генов эукариот

22 ноября 2016, Д.Диброва, А.Алексеевский

[ презентация ] [ задания ] [ контиги ]

Блок 4. Сборка и анализ геномов

13. Ресеквенирование. Поиск полиморфизмов у человека.

29 нояб 2016, А.Жарикова, С.А. Спирин

[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ]

14. Ресеквенирование. Поиск полиморфизмов у человека.

6 дек 2016, А.Жарикова, С.А. Спирин

15. Сборка de novo

13 дек 2016, С.Спирин, А.Жарикова

[ задания ]