Выравнивание seed домена было взято из сайта Pfam.
ID | DO-GTPase2 |
AC | PF19993 |
Число последовательностей в Seed | 43 |
Число последовательностей в Full | 627 |
Паттерны составлялись на основе того, какие аминокислоты входят в блок . Из-за большого числа белков в выравнивании и относительно большой длины блоков паттерны могут иметь небольшое покрытие, так как для их нарушения достаточно всего одного несовпадения с аминокислотой из колонки.
Проект
Тип блока | Паттерн | Координаты |
---|---|---|
Вертикальный плюс-блок (V) | [LIV].[CFVIL].G.{4}GK[TS].{2}[MVLI].{7} | 3-24 |
Частичный плюс-блок (P) | ARW[ILV] | 126-129 |
Минус-блок (M) | - | 163-173 |