База данных Human Protein Atlas


Был выбран ID COQ6, и база данных Human Protein Atlas. В этой базе собрана информация о белках человека, их экспрессии и локализации в разных органах и тканях, а также о влиянии уровня белка на различные процессы в организме в т.ч. на выживаемость пациентов с раковыми заболеваниями. В базе представлена не только информация о белках, но о их РНК и генах, при этом информация связана с другими базами данных, специализирующимися на соответствующих биомолекулах.

Рис.1 Информация о белке и его изоформах

Рис.2 Информация о гене

Исходя из описания по ID COQ6, этот белок является монооксигеназой, которая необходима для синтеза убихинона. Убихинон является неотъемлимым компонентом минтохондриальной электронно-транспортной цепи и участвует в защите клеток от повреждения активными формами кислорода в качестве антиоксиданта. Преимуществом этой базы данных является ее иллюстративность, поэтому в ней можно быстро и легко посмотреть как распределена активность экспрессии этого белка в организме человека в разных органах.

Рис.3. Краткие сведения о белке

У этого белка низкая тканевая специфичность, при этом он активно экспрессируется в органах, интенсивно расходующих энергию. Его очень много в головном мозге, железах внутренней секреции, пищеварительном тракте, легких и костном мозге. В то же время он относительно слабо синтезируется в глазах и мягких тканях.

Рис.4. Распределение белка по органам

База Human Protein Atlas позволяет получить расширенную информацию о распределении этого белка в отделах головного мозга. В случае этого белка это особенно интересно, т.к. головной мозг является одним из самых энергорасходующих органов в организме. Все отделы головного мозга интенсивно экспрессируют этот белок, при этом кора больших полушарий в наибольшей степени, остальные отделы мозга экспрессируют его примерно в равных долях.

Рис.5. Распределение экспресии белка по отделам головного мозга