Структурная классификация

Для сравнения различных вариантов структурной классификации (по данным разных сервисов), я использовала тот же терминатор транскрипции семейства TetR, что и раньше. Найденные границы доменов в базах Pfam, ECOD и CATH представлены в таблице 1.

Таблица 1.Сравнение структурной классификации белка по разным базам данных

Мне не удалось найти свой белок в базе данных SCOP. Ссылка из базы данных Pfam не работает. Домен TetR_N, выделенный Pfam, в этой базе данных присутствует, но Syntrophus aciditrophicus среди представителей этого семейства нет.

Результаты, приведенные в таблице имеют значительные различия по всем базам данных. CATH считает, что белок однодоменный (по одному домену на каждой из практически эквивалентных цепей). В базе данных ECOD он разделен на 2 домена, которые в сумме составляют домен CATH. Такая же ситуация с Pfam, однако, для моей последовательности аннотирван только N-концевой домен, хотя в базе для других последовательностей есть также и C-концевой (называется TetR_C).