Использование сервисов PDB

У быза данных третичных структур PDB есть возможность расширенного поиска По множеству параметров. Чтобы научить пользоваться этим поиском я выполнила поиск структур, полученных методом электронной микроскопии (EM Assembly), которые представляют из себя филаменты. Я использовала фильтрацию, чтобы не оставалось белков со сходством выше 50% аминокислотных остатков. Такой поиск дал 148 результатов.

Если ограничить спектр представленных организмов вирусами, остается 24 записи PDB. Из них 6 содержат информацию о белке капсида. Окончательно запрос выглядит так:

Я сохранила сводную таблицу полученных записей и fasta-файл с их последовательностями. Структуры этих белков капсидов в формате PDB доступны здесь.