Учебный сайт Саши Погорельской Эмблема
Главная Семестры Скрипты Обо мне Ссылки
1 семестр
2 семестр
3 семестр
4 семестр
7 семестр
Эл. плотность
Реконструкция
Файл РСА
Кристалл
ЯМР и РСА
II структура
3D поиск
Гидрофобные кластеры
Поверхность
Структурная классификация
Поиск PDB

Файл результатов РСА экспериментов

Для восстановления структуры транскрипционного регулятора семейства TETR использовались результаты рентгено-структурного анализа. Информацию о структуре можно посмотреть на сайте базы данных PDB (идентификатор 3S5R).

Сокращенный файл с результатами, содержащий амплитуды измеренных рефлексов, можно скачать здесь. В первых 3 колонках записаны индексы рефлексов. Есть информация, какие рефлексы использовались для оптимизации модели, среднее значение измеренных амптитуд для каждого рефлекса и их стандартное отклонение, а также рассчитанные по модели значения и фазы.

Из 16280 использованных для построения электронной плотности значений 92.7% (15 100 рефлексов) имеют достаточную силу сигнала, то есть превышают среднеквадратичное отклонение в 3 или более раз. Для оптимизации модели - 94,2% (15 464 рефлексов).

В эксперименте не могут быть измерены модули всех доступных теоретически структурных факторов. Во-первых, амплитуды рефлексов (маленькие значения индексов рефлексов), соответствующих небольшим векторам рассеяния, не могут измерены из-за наличия заглушки в направлении первичного пучка рентгеновских лучей (например, (0,0,2) или (0,5,0)). Отсутствие некоторых других рефлексов можно объяснить техническими ограничениями эксперимента (например, нет рефлексов с индексами (10,23,10), (11,36,2) и (12,26,4)).





© Pogorelskaya Sasha Last modification date: 13.11.16