Учебный сайт Аксеновой Марины

Визуализация молекул

После того, как структура загрузится, надо нажать две кнопки:

1. Запустить скрипт:

2. Продолжить исполнение скрипта:

Текст скрипта

Jmol output:


С помощью программы Jmol можно получить данные о химических связях в различных молекулах. Для белка фактора элонгации 1-альфа были измерены параметры трех водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре.
Данные представлены в Таблице 1.

Таблица 1. Водородные связи между остовными атомами во вторичной структуре белка Elongation factor 1-alpha
Атом О Атом N Длина связи N-O (нм) Угол между водородными связями и остовым атомом С (N-O-C, °) Вторичная структура
[Ile] 155:B [Lys] 167:B 0,273 164 β-тяж
[Tyr] 56:B [Leu] 52:B 0,281 156,6 α-спираль
[Arg] 53:B [Met] 49:B 0,313 149,6 α-спираль