Kodomo

Пользователь

"Биоинформатика". Межфакультетский курс, весенний семестр 2020

Лекции по средам, время 15:10 – 16:40, ауд. 117, лабораторный корпус Б (схема проезда).


Студенты и результаты


Задать вопрос преподавателям

Посмотреть вопросы и ответы на них


Новости

14 мая

Последнее задание - задание по Л.12 - ДЛЯ НЕ ПОЛЕВЫХ факультетов написано.

Достаточно выполнить один номер из нескольких. Технически простое, не требует большой работы (не такое, как задание по Л10; но, надеюсь, тоже интересное)

Студентам полевых факультетов выполнить его не запрещено. Более того, зачет у ПОЛЕВЫХ факультетов ставится при выполнении заданий любых 10 лекций. Не обязательно первых.

Успехов!

ААл

10 мая

Коллеги!

Правила следует соблюдать.
Сижу и пытаюсь разобраться кому принадлежит скачанный мной файл. 
Потом переименовываю согласно приведенному ранее правилу, чтобы не забыть и не перепутать.
Таких файлов десятки.

Может, лучше бы я это время потратил на проверку?
Вы как считаете?

ААл

10 мая

Задание Л10

Несколько дней тому назад cайт Whatif перестал выполнять задания с сообщением об ошибке в программе.

В задании добавлена инструкция, как его выполнить без сервиса Whatif.

ААл

6 мая Лекция сегодня - С.А.Спирин

Лекция 13-го - М.С. Гельфанд

Студентам ПОЛЕВЫХ факультетов

Зачёт у ПОЛЕВЫХ факультетов — на этой неделе по заданиям Л1-10. Точный Deadline у полевых факультетов определяется учебной частью соответствующего факультета.

Посмотрите в ведомости какие задания Л1-Л7 у вас не зачтены. Побеспокойтесь о них.

Присланные задания Л8-Л10 (у полевых ф-тов) проверю до конца недели. Они отмечены в колонках P, Q, R листа tasks. Присылать ещё можно и нужно. Проверять задания, присланные в последний день, буду, но не хотелось бы (ААл)

ПРОСЬБА Независимо от зачетов и экзаменов посетите лекции сегодня и 13-го, если можете! Не пожалеете, и проявите уважение к нам, лекторам :)

Студенты НЕ полевых факультетов

Официальный зачёт, как было сообщено ранее, 27-го. Задания присылать до 20-го, чтобы мы успели проверить.

6-го и возможно 13-го будут дополнительные задания (13-го попробую придумать по лекции МГ интересное, но легкое задание по геному неандертальца)

Что делать 20-го пока не придумали. Предложения присылайте на почту.

ААл

5 мая

Студенты полевых факультетов!

У вас идет зачетная сессия. Учитывая это, 6-е мая рассматривайте как мягкий deadline.

Однако зачёт надо получить до окончания ВАШЕЙ зачетной сессии - чтобы не было проблем у вас. И на проверку оставьте время.

ААл

Студенты полевых факультетов на которых зачётная сессия заканчивается до 12 мая!

Про биофак знаю. Другие полевые факультеты сообщите мне какое расписание зачетов у вас.

Зачёт МФК будет поставлен 6го мая на основании зачтенных заданий по лекциям 1 - 10.

ААл

Новости

5 мая

Проверены все присланные работы по практикумам 4 и 5. 
Если у Вас не выставлены баллы, но работа была отправлена - напишите мне, пожалуйста.
А.А.Жарикова

17 апреля

Я наконец проверил все присланные мне работы по ДЗ 3.
Прошу прощения за задержку с проверкой.
Есть некоторое количество двоек,я в ближайшее время подготовлю альтернативные задания для пересдачи.
С.А.Спирин

15 апреля

Официально зачет нашего курса МФК 27-го мая.

Для зачета необходимо получить зачёт по всем обязательным заданиям, предлагаемые после каждой лекции. Это либо домашние задания, либо контрольные.

Зачёты автоматом будут известны 20-го мая.

Студенты опоздавшие с выполнением каких-то обязательных заданий имеют возможность выполнить их и прислать для проверки до 20 мая включительно. Проверяться задания будут по типу: зачёт - незачёт. (Ну если очень повезет или нам понравится - не исключаю, что кто-то напишет комментарий. Тем более, если уважительная причина.)

Проверим до 27-го мая. Если не все задания зачтены, то на зачёте 27-го возможно будет устно исправить ошибки, а мы сможем проконтролировать неясные ответы.

ААл

12 апреля
Настя Жарикова: Все присланные мне работы по ДЗ4 проверены.  

26 марта
Настя Жарикова: ДЗ5 готово. Обратите внимание на дедлайны! Они изменены и продлены. 

25 марта
Проверил всю свою почту по МФК. 
Присланные мне выполненные задания по всем лекциям отметил зеленой заливкой в колонке Дата.
Напоминаю, что посылать надо ЛЕКТОРУ, мне можно копию.
Если не послали лектору, то не удивляйтесь потом.

Адреса. 
Спирин  sas собака belozersky точка msu точка ru 
Потапова nadezhdalpotapova собака gmail точка com
Корягина Анна Станиславовна (лекция сегодня)  akaryagina собака gmail точка com

Настя Жарикова написала мне, что ИНДИВИДУАЛЬНЫЕ задания по Л.5 будут готовы сегодня. Она объявит это перед лекцией. 

Адрес записанной лекции 18 марта: http://bit.ly/fbbbioinformatics20200318

Адрес для просмотра лекции 25 марта: https://fbb.lv/fbbmfkbioinf20200325

Адрес для просмотра лекции 8 апреля: https://www.youtube.com/playlist?list=PL4FBZy5tNTEmhYaO4Qh0kkPEXi17MvTwY

Адрес для просмотра лекции 15 апреля: https://fbb.lv/mfkbioinf20200415

Правила и сроки присылки выполненных домашних заданий Выполненные задания n-й лекции отсылайте на e-mail лектора, если не указано другое.

Мягкий deadline - неделя; точнее, до вечера дня следующей, (n+1)-й, лекции. Задания присланные до мягкого deadline проверяются приоритетно: внимательно и с комментариями.

Жесткий deadline - две недели; до вечера дня (n+2)-й лекции. Задания присланные между (n+1)-й и (n+2)-й лекциями проверяются медленнее и менее внимательно.

Задания, присланные после (n+2)-й лекции не проверяются. Исключения - уважительные причины, на усмотрение проверяющего.

Исправления не зачтенных ранее присланных заданий, необходимых для зачета темы, принимаются. См. ниже в каком формате.


Называйте файлы с выполненным заданием так: XXXXXXX_L1.doc

XXXXXXX - ваша фамилия, написанная ЛАТИНСКИМИ буквами.

L1 - задание по теме Лекции 1.

Расширение .doc или любое, которое дает ваш редактор текста

ПОЖАЛУЙСТА!


ВАЖНОЕ ДОПОЛНЕНИЕ

Файл с исправлениями называйте так: XXXXXXX_L1-2.doc и включайте в него только те задания, которые надо перепроверять

Простое исправление можно включить в текст письма.


СОБЛЮДЕНИЕ ЭТИХ ПРАВИЛ УСКОРИТ ПРОВЕРКУ

Иначе, по опыту, минуты уходят на технические детали проверки одной работы, умножаем на 80 присланных работы по одной лекции :(

ААл

Лекция 1. Геном

19 февраля 2020

А. Алексеевский

[ презентация ] [ задания на дом ]

[ комментарии при проверке ] Пока нет

Лекция 2. Изучение человеческого генома

26 февраля 2019

Н. Потапова

[ презентация ] [ задания на дом ]

[ комментарии при проверке ] Пока нет

Лекция 3. Реконструируем эволюцию по белкам

4 марта 2020

С. Спирин

[ презентация ]

[ задания на дом ]

Лекция 4. Секвенирование: что, как и зачем

11 марта 2020

А. Жарикова <azharikova89 AT gmail DOT com>

[ презентация ] [ задания на дом ]

Лекция 5. Секвенирование: что, как и зачем - 2

18 марта 2020, 15:10

А. Жарикова <azharikova89 AT gmail DOT com>

[ презентация ] [ видео ]

[ Задание на дом ] Дедлайн: мягкий — 8 апреля; жесткий — 15 апреля.

Лекция 6. Пространственная структура биополимеров

25 марта 2020, 15:10

А.С. Карягина <akaryagina AT gmail DOT com>

Лекция прочтена онлайн и записана.

[ презентация ] [ видео ] [ задания на дом ]

Лекция 7. Биоинформатика и разработка лекарств

8 апреля 2020, 15:10 или другое время (лекция записана)

А.С. Карягина <akaryagina AT gmail DOT com>

Лекция записана и выложена в YouTube.

[ презентация ] [ видео ]

Лекция 8. Многоуровневое моделирование биомолекул

15 апреля 2020, 15:10

А.О.Залевский <aozalevsky AT gmail DOT com>

[ видео ]

[ задания ] Присылать ААл

Лекция 9. Центральная догма и ее использование вирусами и людьми

22 апреля 2020, 15:10

А. Алексеевский

[ видео ] [ презентация ] [ задания на дом ] задания 1-4. (Пятое вошло в задание Л10).

Лекция 10. Молекулярная эволюция

29 апреля 2020, 15:00 (начнем чуть раньше, т.к. в презентации много слайдов, и все интересные. ААл)

М. Гельфанд

[ видео ] [ презентация ] [ задания на дом ] Присылать ААл [ указания ]

Лекция 11. Выравнивание последовательностей и программа BLAST

6 мая 2020, 15:10

С.А. Спирин

[ презентация ] [ задания на дом ]

Лекция 12. Молекулярная эволюция (вторая часть)

13 мая 2020, 15:10

М. Гельфанд

[ презентация, начиная со слайда 39 ] [ задания на дом ] Присылать ААл


Конференция 13. Как получить зачёт?

20 мая 2020, 15:10

Планируется короткая встреча для вопросов и ответов на них.

Возможно обсуждение заданий. Ведомости с зачётами будут сданы 27го.