Semester 1.
Здесь будут располагаться ссылки на отчеты по будущим практикумам, которые
я буду оформлять в виде HTML страниц. Я уже познакомился с азами работы в программе Far manager.
Блок 4
Практикум 6
Semester 2.
1. Структура белка 5IMD. Jmol
2. Атлас контактов
3. Знакомство с Uniprot
4. Изучение команд Bash
5. EMBOSS и протеомы
6. Практикум 10: Мутации и выравнивания
7. Практикум 11: Выравнивания гомологичных и негомологичных белков
8. Практикум 12: BLAST
9. Практикум 13: Гомология белков
Semester 3.
1. Химическое строение нуклеиновых кислот
2. A- и В- формы ДНК. Структура РНК
3.Комплексы ДНК-белок
4.Секвенирование по Сэнгеру. Анализ хроматограмм.
5.Банки нуклеотидных последовательностей
6.Нуклеотидный BLAST.
7.EMBOSS: пакет программ для анализа последовательностей.
8.Геномные браузеры
9.Поиск и описание полиморфизмов
10.Анализ транскриптомов. Bedtools.
11.Cборка de novo
Semester 4.
1.Филогенетические деревья
4.Практикум 4
6.Практикум 6
7.Практикум 7
8.Практикум 8
9.Практикум 9
11.Практикум 11
12.Практикум 12
13.Практикум 13
Semester 7.
1.Анализ структуры белка с лигандом в PyMOL
2.Электронная плотность
3.Альтернативные положения, B фактор, кристалл
4.ProDy. Синтез Фурье
5.ProDy-2. ЯМР vs РСА
6.Валидация